Para alcançar todo o estado do Ceará, o Instituto Agropolos possui unidades territoriais que oferecem infraestrutura e facilitam a logística dos técnicos que trabalham em campo. Dessa forma o Agropolos fica mais próximo do seu público beneficiado.
Cariri
Serra da Ibiapaba
Vales do Curu e Aracatiaçu
Maciço de Baturité
Vale do Jaguaribe
Sertão Central
Centro Sul e Vale do Salgado
Sertões de Canindé
Sobral
Litoral Leste
Metropolitano José de Alencar
Inhamuns / Crateús